与基于平台的跨境电商企业不同，自营跨境电商企业更类似于传统零售企业，只是将商品交易场所从线下转移到线上。自营跨境电商企业需要全面参与商品的整个供应链，包括所售商品的选择、供应商的开发与谈判、电商平台的运营等。并深度介入物流、客服、售后等服务环节。
由于自营跨境电商在交易主体属性分类上属于B2C模式，不再按交易主体属性模式进行细分，而是根据商品种类分为综合自营跨境电商和垂直自营跨境电商两种类型。
从综合自营跨境电商业务内容来看，其商品来源多接近品牌主，商品加工能力强。此外，它省略了许多中间成本，其商品在价格上有明显优势，但商品数量远少于综合平台型跨境电商，商品品类难以拓展，成本大幅增加。
基于平台的跨境电商的优势在于其开发运营的电商平台。由于不从事商品采购和销售，其运营重点在网站流量挖掘、前期招商和关键辅助服务环节。基于平台的跨境电商关键业务流程在于前期建立平台网站，吸引浏览和开发商家入驻。其日常业务以平台管理为主，包括对商家、商品、消费者和平台本身的管理，保证平台的正常运行，商家和商品的质量和形象，举办各种市场活动促进商品销售，保持与消费者的沟通，从而提高商家和消费者的满意度。
此外，还需要一些相关服务来弥补入驻商家的短板和短板，如支付、客服、物流、监管等工作环节，成为促进平台流量、入驻商家数量、商品销售、消费者满意度的重要服务内容。
然后，根据交易主体类型分析基于平台的跨境电子商务的业务流程。B2B跨境电商模式虽然规模较大，但使用频率不高，与人们的日常消费关联不大，这里就不详细讨论了。因此，基于平台的跨境电商细分为基于B2C平台的跨境电商和基于C2C平台的跨境电商。基于B2C平台的跨境电商在网站流量和商品品类上优势明显，但在品牌投入上存在一定困难，需要在规模和质量之间进行平衡。
这主要是因为目前大商户数量少，平台型跨境电商企业之间的竞争和资源竞争导致大商户难以引入，而小商户虽然数量多，但面临着商户和商品质量控制的问题。
基于C2C平台的跨境电商最大的优势在于商品种类丰富。但由于入驻商家众多，基于C2C平台的跨境电商对卖家和商品的管控力度较弱，容易引发产品质量方面的风险，这也是消费者对C2C平台信任度较低的主要原因。
垂直自营跨境电商最大的优势在于定位和深化小众市场，了解目标群体，深化服务，在商品选择能力和销售转化率方面表现良好。由于其市场定位为小众市场，商品种类单一，受政策因素影响较大。此外，由于垂直自营跨境电商企业规模、实力、流量、管理水平较弱，难以与商品供应商尤其是一些大品牌合作，导致商品价格优势弱于综合自营跨境电商企业。
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